2025Project--QandA

100M大小的fastq文件大约是1000000行，大约？碱基
1G大约是10000000行

    - 'DOMAIN,www.ncbi.nlm.nih.gov,DIRECT'

    - 'DOMAIN-SUFFIX,ncbi.nlm.nih.gov,DIRECT'

chatgpt问答：
1.调整柱子间距
通过调整柱状图的宽度和设置每个柱状图的位置来实现

python3 /share/nas2/yuj/cleanup.py   -d  /share/nas2/yuj/project/2025   -e   /share/nas2/yuj/project/2025/re-sequencing/GP-20250423-10783_20250424   /share/nas2/yuj/project/2025/re-sequencing/GP-20241021-9521-2_20250104   /share/nas2/yuj/project/2025/mitochondrion/GP-20250220-10415_20250317    -x  svg    --dry-run  -v

######2025年######

202505--------------------------

202504--------------------------

18周 20250428-20250504

Todo

9521-2 棉花标记开发
【农口：群体-重测序】GP-20250423-10783 福建农林大学甘蔗重测序数据SNP位点鉴定
【农口：分子-物种鉴定】GP-20250418-10759 浙江省海洋水产研究所11个河豚3对引物扩增测序（需要分析，做物种鉴定）

Faq

【项目售后答疑】GP-20230713-6423-3 青海省畜牧兽医科学院两个贝叶斯系统发育树

17周 20250421-20250427

Todo

9521-2 棉花标记开发
【农口：纯分析-叶绿体-作图+个性分析】GP-20250214-10393 江苏省农科院经作所赵亮马铃薯叶绿体文章-修改补充分析
【农口：纯分析-标记开发】GP-20250414-10726 华润三九医药魏民叶绿体基因组特异性引物开发数据分析
http://192.168.1.200:5006/ 本地目录 /share/nas1/yuj/local_web/markdown-blog-linux-amd64/md
【农口：群体-重测序】GP-20250423-10783 福建农林大学甘蔗重测序数据SNP位点鉴定
【农口：纯分析-构建进化树】GP-20230713-6423-3 青海省畜牧兽医科学院两个贝叶斯系统发育树

Faq

【项目答疑-2】GP-20240906-9153浙江园林植物花卉研究所一份样品叶绿体测序分析
8014mt 散在重复序列
10415 方法

16周 20250414-20250420

Todo

加急【农口：重测序-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-重测序
9521-2 棉花标记开发
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20250411-10708朱顺2个女贞叶绿体数据组装分析（用GP-20250321-10586数据）
【农口：叶绿体-数据下机-标准+高级分析】GP-20250407-10676 南京林业大学1个安息香科植物叶绿体基因组测序分析
【农口：纯分析-叶绿体-作图+个性分析】GP-20250214-10393 江苏省农科院经作所赵亮马铃薯叶绿体文章-修改补充分析

15周 20250407-20250413

Todo

加急【农口：动物线粒体-数据下机】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-动物线粒体
加急【农口：重测序-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-重测序
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20250226-10447-1贵州省毕节市中药研究所1份斛蕨的线粒体和叶绿体测序分析-叶绿体
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20250311-10519-1青海民族大学1个苔藓叶绿体基因组测序分析
【农口：动物线粒体-数据下机】GP-20250312-10532-1 贵州大学动物科学院董老师1个鱼线粒体测序标准分析
9521-2 棉花标记开发
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20250411-10708朱顺2个女贞叶绿体数据组装分析（用GP-20250321-10586数据）

Faq

【农口：项目答疑1-真菌重测序】GP-20250117-10322 江苏省农科院陈贤1个真菌重测序实验

14周 20250331-20250406

Todo

【农口：群体-数据下机-遗传多样性分析】GP-20221116-5251-2青海大学农牧学院朱老师遗传多样性分析-共提取165个样本-正式实验
加急【农口：动物线粒体-数据下机】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-动物线粒体
加急【农口：重测序-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-重测序
【医口：基因组-数据下机-修改报告】GP-20250219-10411南京一文生物洪涛5个样品外显子测序分析
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20250226-10447-1贵州省毕节市中药研究所1份斛蕨的线粒体和叶绿体测序分析-叶绿体
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20250311-10519-1青海民族大学1个苔藓叶绿体基因组测序分析
【农口：动物线粒体-数据下机】GP-20250312-10532-1 贵州大学动物科学院董老师1个鱼线粒体测序标准分析

Faq

【项目答疑-叶绿体1】GP-20231016-7048-2湖南人文1个槠叶齐线粒体测序分析
【农口：项目答疑1-真菌重测序】GP-20250117-10322 江苏省农科院陈贤1个真菌重测序实验

202503--------------------------

13周 20250324-20250330

Todo

【农口：群体-数据下机-遗传多样性分析】GP-20221116-5251-2青海大学农牧学院朱老师遗传多样性分析-共提取165个样本-正式实验
加急【农口：动物线粒体-数据下机】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-动物线粒体
【农口：个性分析】GP-20241021-9521-2江苏省农科院经作所赵君23个棉花个性分析
加急【农口：重测序-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-重测序
【医口：基因组-数据下机-修改报告】GP-20250219-10411南京一文生物洪涛5个样品外显子测序分析

Faq

【项目答疑-1】GP-20241210-10034 武夷学院1份苔藓样本叶绿体测序分析
【项目答疑-叶绿体1】GP-20231016-7048-2湖南人文1个槠叶齐线粒体测序分析
7048-1统计

12周 20250317-20250323

Todo

【农口：动物线粒体-组装】GP-20241216-10074湖南人文科技学院5个蚜虫线粒体测序分析-二代+重新送样组织
【农口：群体-数据下机-遗传多样性分析】GP-20221116-5251-2青海大学农牧学院朱老师遗传多样性分析-共提取165个样本-正式实验
【农口：简化-数据下机】GP-20241212-10055-1南京师范大学1份样本简化基因组测序
加急【农口：动物线粒体-数据下机】GP-20250220-10415上海海洋大学100份样本重测序＋线粒体测序分析-动物线粒体
【农口：个性分析】GP-20241021-9521-2江苏省农科院经作所赵君23个棉花个性分析

11周 20250310-20250316

Todo

【叶绿体+标记筛选-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20211022-3553-6刘晶老师4个样品叶绿体基因组重测序分析
【农口：动物线粒体-组装】GP-20241216-10074湖南人文科技学院5个蚜虫线粒体测序分析-二代+重新送样组织
【农口：真菌重测序-数据下机】GP-20250117-10322 江苏省农科院陈贤1个真菌重测序实验
【加急：农口-数据下机-叶绿体-标准分析】GP-20230811-6596内蒙农科院2份植物线粒体+叶绿体测序分析-叶绿体
【加急：农口-数据下机-叶绿体-标准分析+1个样本高级分析】GP-20230811-6596内蒙农科院2份植物线粒体+叶绿体测序分析-叶绿体
【农口：叶绿体-数据下机-标准+高级分析】GP-20250115-10293内蒙农大五个植物叶绿体测序分析
【农口：群体-数据下机-遗传多样性分析】GP-20221116-5251-2青海大学农牧学院朱老师遗传多样性分析-共提取165个样本-正式实验
【农口：简化-数据下机】GP-20241212-10055-1南京师范大学1份样本简化基因组测序

10周 20250303-20250309

Todo

【叶绿体+标记筛选-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20211022-3553-6刘晶老师4个样品叶绿体基因组重测序分析
【农口：动物线粒体-组装】GP-20241216-10074湖南人文科技学院5个蚜虫线粒体测序分析-二代+重新送样组织
【农口：真菌重测序-数据下机】GP-20250117-10322 江苏省农科院陈贤1个真菌重测序实验

Faq

【项目答疑-1】GP-20240826-9045-2皖南医学院3份样本线粒体测序分析
加急【项目答疑-1】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份
【项目答疑-4】GP-20231008-6976-1云大生态学院石鸿迪一个叶蜂线粒体基因组组装测序分析（2+3代）
【项目答疑-2】GP-20241012-9435-5云农大猪2个线粒体测序分析+170个样一代测序
【项目答疑-1】GP-20231016-7048-1湖南人文1个白毫早线粒体测序分析-叶绿体

202502--------------------------

9周 20250224-20250302

Todo

【叶绿体+标记筛选-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20211022-3553-6刘晶老师4个样品叶绿体基因组重测序分析
【农口：动物线粒体-组装】GP-20241216-10074湖南人文科技学院5个蚜虫线粒体测序分析-二代+重新送样组织
【农口：叶绿体-数据下机-组装注释】GP-20210704-3174-5海南大学1个辣椒叶绿体+线粒体基因组测序分析
【农口：真菌重测序-数据下机】GP-20250117-10322 江苏省农科院陈贤1个真菌重测序实验

Faq

【项目答疑-1】GP-20240826-9045-2皖南医学院3份样本线粒体测序分析
加急【项目答疑-1】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份
【项目答疑-4】GP-20231008-6976-1云大生态学院石鸿迪一个叶蜂线粒体基因组组装测序分析（2+3代）
【项目答疑-2】GP-20241012-9435-5云农大猪2个线粒体测序分析+170个样一代测序
加急【项目答疑-2】GP-20230628-6331-2 湖南人文一个生菜细胞器测序分析-叶绿体
【项目答疑-2】GP-20241012-9435-5云农大猪2个线粒体测序分析+170个样一代测序

8周 20250217-20250223

Todo

【农口：重测序-数据下机+个性分析】GP-20241021-9521-2江苏省农科院经作所赵君23个棉花重测序分析
【叶绿体+标记筛选-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20211022-3553-6刘晶老师4个样品叶绿体基因组重测序分析

Faq

【项目答疑-1】GP-20240906-9153浙江园林植物花卉研究所一份样品叶绿体测序分析
【项目答疑-1】GP-20240826-9045-2皖南医学院3份样本线粒体测序分析
加急【项目答疑-1】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份
【项目答疑-4】GP-20231008-6976-1云大生态学院石鸿迪一个叶蜂线粒体基因组组装测序分析（2+3代）

7周 20250210-20250216

Todo

【分析下单-高级分析+个性分析】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份
【农口：重测序-数据下机+个性分析】GP-20241021-9521-2江苏省农科院经作所赵君23个棉花重测序分析
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20241230-10200自然资源部第三海洋研究所2份样品叶绿体测序分析
【农口：叶绿体-数据下机-标准+高级分析】GP-20241220-10124贵州习水保护区1个特色植物秃房茶叶绿体基因组
【叶绿体+标记筛选-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20211022-3553-6刘晶老师4个样品叶绿体基因组重测序分析
【农口：项目反馈-动物线粒体-标准分析】GP-20240904-9128-1青海民大张老师预付款5000元--1个动物线粒体基因组测序分析

Faq

【项目答疑-1】GP-20221212-5417-4安师大2份样品叶绿体测序分析
【项目答疑-1】GP-20240906-9153浙江园林植物花卉研究所一份样品叶绿体测序分析
【项目答疑-1】GP-20240826-9045-2皖南医学院3份样本线粒体测序分析
加急【项目答疑-1】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份

202501--------------------------

4周 20250120-20250126

Todo

【农口：动物线粒体-数据下机-样本比对分析】GP-20240826-9045-2皖南医学院3份样本线粒体测序分析
【分析下单-高级分析+个性分析】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份
【农口：重测序-数据下机+个性分析】GP-20241021-9521-2江苏省农科院经作所赵君23个棉花重测序分析
甲基化数据比对
【农口：叶绿体-数据下机-标准分析】GP-20241230-10200自然资源部第三海洋研究所2份样品叶绿体测序分析
【农口：叶绿体-数据下机-标准+高级分析】GP-20241220-10124贵州习水保护区1个特色植物秃房茶叶绿体基因组
【叶绿体+标记筛选-数据下机-标准分析+个性分析】GP-20211022-3553-6刘晶老师4个样品叶绿体基因组重测序分析

Faq

【项目答疑-1】GP-20221212-5417-4安师大2份样品叶绿体测序分析

3周 20250113-20250119

Todo

【个性分析下单】GP-20241218-10108江苏省农科院种质资源平台刘彩云小麦数据个性分析
【农口：动物线粒体-数据下机-样本比对分析】GP-20240826-9045-2皖南医学院3份样本线粒体测序分析 先不做
【分析下单-高级分析+个性分析】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份
【农口：重测序-数据下机+个性分析】GP-20241021-9521-2江苏省农科院经作所赵君23个棉花重测序分析
【农口：真菌重测序-数据下机】GP-20241223-10147 南京瑞源生物曾老师3个真菌重测序
【叶绿体-纯分析-高级分析】GP-20241227-10183 浩瑞基因1个铁线莲叶绿体及线粒体标准+高级分析-叶绿体
甲基化数据比对

Faq

【项目答疑-1】GP-20241012-9435-5云农大猪2个线粒体测序分析+170个样一代测序

2周 20250106-20250112

Todo

【个性分析下单】GP-20241218-10108江苏省农科院种质资源平台刘彩云小麦数据个性分析
【农口：动物线粒体-数据下机-样本比对分析】GP-20240826-9045-2皖南医学院3份样本线粒体测序分析 先不做
【分析下单-高级分析+个性分析】GP-20240701-8669华东师范82份金线莲叶绿体测序-实际87份
【农口：重测序-数据下机+个性分析】GP-20241021-9521-2江苏省农科院经作所赵君23个棉花重测序分析
【农口：叶绿体-数据下机-高级分析】GP-20241203-9976-1北京市农科院白老师1个叶绿体基因组测序
【农口：叶绿体-数据下机-高级分析】GP-20241203-9976-2北京农林科学院白老师1个叶绿体基因组测序
【农口：真菌重测序-数据下机】GP-20241223-10147 南京瑞源生物曾老师3个真菌重测序
【医口：线粒体-数据下机】GP-20241227-10180复旦大学附属肿瘤医院4份线粒体靶向捕获测序分析 不用管
【叶绿体-纯分析-标准分析】GP-20241227-10183 浩瑞基因1个铁线莲叶绿体及线粒体标准+高级分析-叶绿体

Faq

【项目答疑-1】GP-20221026-5130-2湖南人文农大5个叶绿体测序分析-实际4个+5130-3项目一个样本
GP-20230707-6373 QA3

1周 20241230-20250105

Faq

【项目答疑-2】GP-20221202-5360-4南昌师范学院2个植物叶绿体基因组测序分析